Instalación de QIIME 2

Requisitos previos:

Linux o macOS (QIIME 2 no es compatible con Windows, pero puedes usar una máquina virtual o un entorno basado en contenedores como Docker).
Python 3.6 o superior.

Pasos generales para la instalación:

Crear un entorno virtual (opcional pero recomendado):
- Crea un entorno virtual para QIIME 2 utilizando conda. Puedes instalar conda desde Anaconda o Miniconda. Para instalar conda se pueden utilizar los siguientes comandos:
```
curl -L -O "https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-$(uname)-$(uname -m).sh"

bash Miniforge3-Linux-x86_64.sh

source ~/.bashrc

conda config --add channels bioconda

conda config --add channels conda-forge
```
- Ten en cuenta que "2024.5" es la versión específica de QIIME 2. Puedes verificar la versión más reciente en la página de instalación de QIIME 2.
Instalar QIIME 2:
- Utiliza el siguiente comando para instalar QIIME 2 en el entorno virtual que creaste.
```
conda env create -n qiime2-amplicon-2024.5 --file https://data.qiime2.org/distro/amplicon/qiime2-amplicon-2024.5-py39-linux-conda.yml

conda activate qiime2-amplicon-2024.5
```
- Esto instalará la versión específica de QIIME 2 (2023.9) junto con las dependencias necesarias.
Activar QIIME 2:
- Después de la instalación, activa el entorno QIIME 2.
```
conda activate qiime2-amplicon-2024.5
```
Verificar la instalación:
- Puedes verificar que QIIME 2 está instalado correctamente ejecutando el siguiente comando:
```
qiime info
```
- Esto debería mostrar la ayuda de QIIME 2.

Recuerda que estos pasos están basados en la información disponible hasta la última actualización disponible al 1 de Diciembre del 2023. Te recomiendo consultar la documentación oficial de QIIME 2 para obtener la información más reciente sobre la instalación.